Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD300CQ08708 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms