Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms