Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms