Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SOS1Q07889 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOS1Q07889 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SOS1Q07889 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
SOS1Q07889 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOS1Q07889 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms