Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL16A1Q07092 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms