Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms