Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
REG3AQ06141 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms