Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms