Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
XPCQ01831 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XPCQ01831 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XPCQ01831 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XPCQ01831 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XPCQ01831 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XPCQ01831 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XPCQ01831 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XPCQ01831 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XPCQ01831 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XPCQ01831 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
XPCQ01831 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
XPCQ01831 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
XPCQ01831 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
XPCQ01831 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
XPCQ01831 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
XPCQ01831 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XPCQ01831 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
XPCQ01831 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
XPCQ01831 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
XPCQ01831 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
XPCQ01831 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
XPCQ01831 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
XPCQ01831 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
XPCQ01831 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
XPCQ01831 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
XPCQ01831 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
XPCQ01831 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
XPCQ01831 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XPCQ01831 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XPCQ01831 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XPCQ01831 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XPCQ01831 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XPCQ01831 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XPCQ01831 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XPCQ01831 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
XPCQ01831 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
XPCQ01831 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
XPCQ01831 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XPCQ01831 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XPCQ01831 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
XPCQ01831 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XPCQ01831 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XPCQ01831 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XPCQ01831 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XPCQ01831 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XPCQ01831 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XPCQ01831 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XPCQ01831 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XPCQ01831 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XPCQ01831 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XPCQ01831 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XPCQ01831 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XPCQ01831 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XPCQ01831 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XPCQ01831 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
XPCQ01831 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
XPCQ01831 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
XPCQ01831 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XPCQ01831 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XPCQ01831 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XPCQ01831 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XPCQ01831 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XPCQ01831 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XPCQ01831 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XPCQ01831 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XPCQ01831 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XPCQ01831 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XPCQ01831 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XPCQ01831 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XPCQ01831 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XPCQ01831 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XPCQ01831 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
XPCQ01831 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XPCQ01831 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XPCQ01831 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XPCQ01831 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XPCQ01831 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XPCQ01831 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
XPCQ01831 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XPCQ01831 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XPCQ01831 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XPCQ01831 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XPCQ01831 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XPCQ01831 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XPCQ01831 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XPCQ01831 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XPCQ01831 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XPCQ01831 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
XPCQ01831 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XPCQ01831 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XPCQ01831 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XPCQ01831 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XPCQ01831 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XPCQ01831 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XPCQ01831 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XPCQ01831 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XPCQ01831 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XPCQ01831 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XPCQ01831 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms