Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F1Q01094 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms