Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HBBP68871 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HBBP68871 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HBBP68871 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HBBP68871 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HBBP68871 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HBBP68871 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HBBP68871 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HBBP68871 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms