Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms