Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTBP2P56545 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms