Protein–RNA interactions for Protein: P53985

SLC16A1, Monocarboxylate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A1P53985 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC16A1P53985 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms