Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPAP49450 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPAP49450 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPAP49450 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPAP49450 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPAP49450 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPAP49450 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPAP49450 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPAP49450 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CENPAP49450 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CENPAP49450 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CENPAP49450 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CENPAP49450 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CENPAP49450 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPAP49450 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPAP49450 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPAP49450 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPAP49450 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPAP49450 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPAP49450 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPAP49450 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPAP49450 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPAP49450 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPAP49450 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPAP49450 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPAP49450 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPAP49450 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPAP49450 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPAP49450 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPAP49450 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPAP49450 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPAP49450 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPAP49450 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPAP49450 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPAP49450 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPAP49450 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPAP49450 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPAP49450 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPAP49450 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPAP49450 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPAP49450 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPAP49450 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPAP49450 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPAP49450 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPAP49450 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPAP49450 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPAP49450 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPAP49450 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPAP49450 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPAP49450 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPAP49450 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPAP49450 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPAP49450 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPAP49450 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPAP49450 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPAP49450 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPAP49450 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPAP49450 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPAP49450 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPAP49450 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPAP49450 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPAP49450 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPAP49450 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPAP49450 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPAP49450 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPAP49450 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPAP49450 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPAP49450 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPAP49450 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPAP49450 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPAP49450 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPAP49450 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPAP49450 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPAP49450 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPAP49450 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPAP49450 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPAP49450 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPAP49450 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPAP49450 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPAP49450 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPAP49450 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPAP49450 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPAP49450 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPAP49450 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPAP49450 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPAP49450 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPAP49450 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPAP49450 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPAP49450 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPAP49450 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPAP49450 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPAP49450 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPAP49450 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPAP49450 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPAP49450 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPAP49450 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPAP49450 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPAP49450 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPAP49450 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPAP49450 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms