Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FNTBP49356 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FNTBP49356 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FNTBP49356 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FNTBP49356 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FNTBP49356 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FNTBP49356 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FNTBP49356 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FNTBP49356 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FNTBP49356 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FNTBP49356 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FNTBP49356 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FNTBP49356 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FNTBP49356 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FNTBP49356 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FNTBP49356 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FNTBP49356 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FNTBP49356 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FNTBP49356 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FNTBP49356 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FNTBP49356 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FNTBP49356 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FNTBP49356 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
FNTBP49356 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
FNTBP49356 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FNTBP49356 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FNTBP49356 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FNTBP49356 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
FNTBP49356 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FNTBP49356 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FNTBP49356 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FNTBP49356 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FNTBP49356 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FNTBP49356 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FNTBP49356 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FNTBP49356 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FNTBP49356 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FNTBP49356 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FNTBP49356 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FNTBP49356 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FNTBP49356 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FNTBP49356 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FNTBP49356 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FNTBP49356 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FNTBP49356 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FNTBP49356 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FNTBP49356 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FNTBP49356 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FNTBP49356 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FNTBP49356 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FNTBP49356 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FNTBP49356 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FNTBP49356 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FNTBP49356 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FNTBP49356 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FNTBP49356 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FNTBP49356 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FNTBP49356 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FNTBP49356 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FNTBP49356 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FNTBP49356 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FNTBP49356 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FNTBP49356 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FNTBP49356 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FNTBP49356 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FNTBP49356 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FNTBP49356 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FNTBP49356 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FNTBP49356 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FNTBP49356 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FNTBP49356 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FNTBP49356 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FNTBP49356 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FNTBP49356 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FNTBP49356 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FNTBP49356 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FNTBP49356 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FNTBP49356 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FNTBP49356 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FNTBP49356 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FNTBP49356 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FNTBP49356 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FNTBP49356 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FNTBP49356 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FNTBP49356 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FNTBP49356 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FNTBP49356 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FNTBP49356 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FNTBP49356 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FNTBP49356 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FNTBP49356 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FNTBP49356 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FNTBP49356 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FNTBP49356 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FNTBP49356 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FNTBP49356 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FNTBP49356 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FNTBP49356 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FNTBP49356 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FNTBP49356 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms