Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5OP48047 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms