Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPA3P35244 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RPA3P35244 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPA3P35244 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPA3P35244 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPA3P35244 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPA3P35244 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPA3P35244 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPA3P35244 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPA3P35244 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPA3P35244 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPA3P35244 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPA3P35244 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPA3P35244 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPA3P35244 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA3P35244 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA3P35244 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA3P35244 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA3P35244 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA3P35244 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA3P35244 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA3P35244 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA3P35244 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA3P35244 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA3P35244 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA3P35244 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA3P35244 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA3P35244 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA3P35244 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA3P35244 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA3P35244 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA3P35244 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA3P35244 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA3P35244 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA3P35244 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA3P35244 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA3P35244 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA3P35244 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA3P35244 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA3P35244 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA3P35244 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA3P35244 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA3P35244 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA3P35244 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA3P35244 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA3P35244 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA3P35244 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA3P35244 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA3P35244 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA3P35244 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPA3P35244 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA3P35244 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA3P35244 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA3P35244 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA3P35244 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA3P35244 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA3P35244 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA3P35244 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA3P35244 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA3P35244 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA3P35244 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA3P35244 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA3P35244 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA3P35244 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA3P35244 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA3P35244 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA3P35244 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA3P35244 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA3P35244 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA3P35244 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA3P35244 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA3P35244 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA3P35244 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA3P35244 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA3P35244 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA3P35244 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA3P35244 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA3P35244 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA3P35244 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA3P35244 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA3P35244 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA3P35244 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA3P35244 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA3P35244 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA3P35244 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA3P35244 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA3P35244 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA3P35244 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA3P35244 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPA3P35244 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA3P35244 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA3P35244 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA3P35244 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA3P35244 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA3P35244 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA3P35244 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA3P35244 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA3P35244 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA3P35244 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RPA3P35244 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms