Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-FP30511 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-FP30511 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-FP30511 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-FP30511 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-FP30511 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-FP30511 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-FP30511 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-FP30511 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-FP30511 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-FP30511 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-FP30511 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-FP30511 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-FP30511 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-FP30511 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-FP30511 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-FP30511 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms