Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP1P29466 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP1P29466 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP1P29466 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP1P29466 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP1P29466 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP1P29466 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP1P29466 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP1P29466 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP1P29466 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP1P29466 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP1P29466 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP1P29466 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP1P29466 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP1P29466 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP1P29466 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP1P29466 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP1P29466 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP1P29466 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP1P29466 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP1P29466 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP1P29466 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP1P29466 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP1P29466 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP1P29466 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP1P29466 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP1P29466 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASP1P29466 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP1P29466 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP1P29466 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP1P29466 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP1P29466 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP1P29466 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP1P29466 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP1P29466 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP1P29466 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP1P29466 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP1P29466 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP1P29466 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP1P29466 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP1P29466 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP1P29466 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP1P29466 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP1P29466 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP1P29466 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP1P29466 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP1P29466 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP1P29466 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP1P29466 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP1P29466 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP1P29466 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP1P29466 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP1P29466 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP1P29466 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP1P29466 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP1P29466 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP1P29466 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP1P29466 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP1P29466 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP1P29466 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP1P29466 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP1P29466 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP1P29466 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP1P29466 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP1P29466 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP1P29466 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP1P29466 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP1P29466 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP1P29466 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP1P29466 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASP1P29466 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP1P29466 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms