Protein–RNA interactions for Protein: P21291

CSRP1, Cysteine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP1P21291 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSRP1P21291 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSRP1P21291 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms