Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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RAB5AP20339 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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RAB5AP20339 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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RAB5AP20339 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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RAB5AP20339 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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RAB5AP20339 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB5AP20339 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB5AP20339 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB5AP20339 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB5AP20339 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB5AP20339 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB5AP20339 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB5AP20339 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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