Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SDSP20132 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SDSP20132 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SDSP20132 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SDSP20132 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SDSP20132 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SDSP20132 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SDSP20132 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SDSP20132 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SDSP20132 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SDSP20132 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SDSP20132 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SDSP20132 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SDSP20132 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SDSP20132 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SDSP20132 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SDSP20132 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SDSP20132 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SDSP20132 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SDSP20132 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SDSP20132 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SDSP20132 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SDSP20132 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SDSP20132 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SDSP20132 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SDSP20132 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SDSP20132 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SDSP20132 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
SDSP20132 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
SDSP20132 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SDSP20132 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SDSP20132 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SDSP20132 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SDSP20132 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SDSP20132 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SDSP20132 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SDSP20132 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SDSP20132 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SDSP20132 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SDSP20132 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SDSP20132 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SDSP20132 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SDSP20132 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SDSP20132 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SDSP20132 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SDSP20132 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SDSP20132 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SDSP20132 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SDSP20132 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SDSP20132 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SDSP20132 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SDSP20132 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SDSP20132 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SDSP20132 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SDSP20132 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDSP20132 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDSP20132 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDSP20132 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDSP20132 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDSP20132 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDSP20132 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDSP20132 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDSP20132 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDSP20132 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDSP20132 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDSP20132 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDSP20132 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDSP20132 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDSP20132 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDSP20132 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SDSP20132 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDSP20132 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDSP20132 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDSP20132 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDSP20132 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SDSP20132 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDSP20132 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDSP20132 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDSP20132 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDSP20132 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDSP20132 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDSP20132 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDSP20132 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDSP20132 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SDSP20132 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SDSP20132 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDSP20132 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDSP20132 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDSP20132 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDSP20132 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDSP20132 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDSP20132 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDSP20132 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SDSP20132 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDSP20132 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SDSP20132 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDSP20132 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDSP20132 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDSP20132 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SDSP20132 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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