Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LIG1P18858 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LIG1P18858 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LIG1P18858 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
LIG1P18858 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LIG1P18858 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
LIG1P18858 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LIG1P18858 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LIG1P18858 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LIG1P18858 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LIG1P18858 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LIG1P18858 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LIG1P18858 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LIG1P18858 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LIG1P18858 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LIG1P18858 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LIG1P18858 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LIG1P18858 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LIG1P18858 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LIG1P18858 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LIG1P18858 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LIG1P18858 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LIG1P18858 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LIG1P18858 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LIG1P18858 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LIG1P18858 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LIG1P18858 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LIG1P18858 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LIG1P18858 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LIG1P18858 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LIG1P18858 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LIG1P18858 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LIG1P18858 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LIG1P18858 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LIG1P18858 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LIG1P18858 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LIG1P18858 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LIG1P18858 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LIG1P18858 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LIG1P18858 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LIG1P18858 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LIG1P18858 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LIG1P18858 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LIG1P18858 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LIG1P18858 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LIG1P18858 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LIG1P18858 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LIG1P18858 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LIG1P18858 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LIG1P18858 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LIG1P18858 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LIG1P18858 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LIG1P18858 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LIG1P18858 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LIG1P18858 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LIG1P18858 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LIG1P18858 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LIG1P18858 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LIG1P18858 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LIG1P18858 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LIG1P18858 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LIG1P18858 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LIG1P18858 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LIG1P18858 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LIG1P18858 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LIG1P18858 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LIG1P18858 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LIG1P18858 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LIG1P18858 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LIG1P18858 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LIG1P18858 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LIG1P18858 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LIG1P18858 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LIG1P18858 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LIG1P18858 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LIG1P18858 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LIG1P18858 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LIG1P18858 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LIG1P18858 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LIG1P18858 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LIG1P18858 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LIG1P18858 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LIG1P18858 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LIG1P18858 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LIG1P18858 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LIG1P18858 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LIG1P18858 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LIG1P18858 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LIG1P18858 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LIG1P18858 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LIG1P18858 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LIG1P18858 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LIG1P18858 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LIG1P18858 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LIG1P18858 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LIG1P18858 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LIG1P18858 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LIG1P18858 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LIG1P18858 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LIG1P18858 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms