Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSPP15924 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSPP15924 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSPP15924 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSPP15924 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSPP15924 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSPP15924 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSPP15924 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSPP15924 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
DSPP15924 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSPP15924 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSPP15924 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSPP15924 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSPP15924 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSPP15924 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSPP15924 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSPP15924 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSPP15924 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSPP15924 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSPP15924 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSPP15924 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DSPP15924 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSPP15924 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSPP15924 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSPP15924 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSPP15924 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSPP15924 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSPP15924 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSPP15924 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSPP15924 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSPP15924 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSPP15924 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSPP15924 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSPP15924 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSPP15924 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSPP15924 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSPP15924 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSPP15924 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DSPP15924 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSPP15924 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSPP15924 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSPP15924 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSPP15924 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSPP15924 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSPP15924 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSPP15924 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSPP15924 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSPP15924 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSPP15924 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSPP15924 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSPP15924 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSPP15924 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSPP15924 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSPP15924 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DSPP15924 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DSPP15924 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DSPP15924 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DSPP15924 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSPP15924 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSPP15924 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSPP15924 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSPP15924 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSPP15924 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSPP15924 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSPP15924 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSPP15924 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSPP15924 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DSPP15924 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSPP15924 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSPP15924 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSPP15924 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSPP15924 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSPP15924 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSPP15924 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSPP15924 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSPP15924 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSPP15924 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSPP15924 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DSPP15924 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DSPP15924 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSPP15924 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSPP15924 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSPP15924 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSPP15924 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms