Protein–RNA interactions for Protein: P12955

PEPD, Xaa-Pro dipeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEPDP12955 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PEPDP12955 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PEPDP12955 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PEPDP12955 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PEPDP12955 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PEPDP12955 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PEPDP12955 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PEPDP12955 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PEPDP12955 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PEPDP12955 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PEPDP12955 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PEPDP12955 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PEPDP12955 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEPDP12955 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEPDP12955 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEPDP12955 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEPDP12955 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEPDP12955 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEPDP12955 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEPDP12955 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEPDP12955 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PEPDP12955 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEPDP12955 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEPDP12955 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEPDP12955 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEPDP12955 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEPDP12955 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEPDP12955 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PEPDP12955 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEPDP12955 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PEPDP12955 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEPDP12955 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEPDP12955 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEPDP12955 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEPDP12955 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEPDP12955 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PEPDP12955 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEPDP12955 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEPDP12955 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEPDP12955 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEPDP12955 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEPDP12955 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEPDP12955 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEPDP12955 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEPDP12955 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEPDP12955 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEPDP12955 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEPDP12955 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEPDP12955 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEPDP12955 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEPDP12955 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEPDP12955 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEPDP12955 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEPDP12955 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEPDP12955 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEPDP12955 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEPDP12955 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEPDP12955 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEPDP12955 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEPDP12955 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEPDP12955 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEPDP12955 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEPDP12955 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEPDP12955 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PEPDP12955 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEPDP12955 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEPDP12955 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEPDP12955 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEPDP12955 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEPDP12955 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEPDP12955 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEPDP12955 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEPDP12955 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEPDP12955 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEPDP12955 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEPDP12955 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEPDP12955 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PEPDP12955 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEPDP12955 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEPDP12955 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEPDP12955 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEPDP12955 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEPDP12955 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEPDP12955 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEPDP12955 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEPDP12955 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEPDP12955 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEPDP12955 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEPDP12955 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEPDP12955 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEPDP12955 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEPDP12955 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEPDP12955 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEPDP12955 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEPDP12955 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEPDP12955 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEPDP12955 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEPDP12955 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEPDP12955 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEPDP12955 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms