Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGAMP11215 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms