Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
LAMC1P11047 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMC1P11047 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms