Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00032P0C843 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms