Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEFLP07196 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEFLP07196 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEFLP07196 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEFLP07196 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEFLP07196 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEFLP07196 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEFLP07196 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEFLP07196 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NEFLP07196 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEFLP07196 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEFLP07196 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEFLP07196 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEFLP07196 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEFLP07196 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NEFLP07196 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEFLP07196 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEFLP07196 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEFLP07196 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEFLP07196 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEFLP07196 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEFLP07196 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEFLP07196 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEFLP07196 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEFLP07196 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEFLP07196 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEFLP07196 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEFLP07196 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEFLP07196 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEFLP07196 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NEFLP07196 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NEFLP07196 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEFLP07196 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEFLP07196 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEFLP07196 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEFLP07196 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEFLP07196 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NEFLP07196 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEFLP07196 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEFLP07196 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEFLP07196 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEFLP07196 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEFLP07196 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEFLP07196 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEFLP07196 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEFLP07196 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEFLP07196 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEFLP07196 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEFLP07196 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEFLP07196 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEFLP07196 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEFLP07196 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEFLP07196 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEFLP07196 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEFLP07196 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEFLP07196 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NEFLP07196 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEFLP07196 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEFLP07196 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEFLP07196 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEFLP07196 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEFLP07196 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEFLP07196 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEFLP07196 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEFLP07196 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEFLP07196 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEFLP07196 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEFLP07196 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEFLP07196 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEFLP07196 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEFLP07196 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEFLP07196 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEFLP07196 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NEFLP07196 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEFLP07196 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEFLP07196 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEFLP07196 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEFLP07196 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEFLP07196 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEFLP07196 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEFLP07196 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEFLP07196 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEFLP07196 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEFLP07196 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEFLP07196 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEFLP07196 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEFLP07196 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEFLP07196 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEFLP07196 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEFLP07196 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEFLP07196 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEFLP07196 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEFLP07196 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEFLP07196 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEFLP07196 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEFLP07196 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NEFLP07196 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEFLP07196 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEFLP07196 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEFLP07196 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms