Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZBED1O96006 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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