Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX7O95931 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX7O95931 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX7O95931 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX7O95931 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX7O95931 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX7O95931 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX7O95931 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX7O95931 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX7O95931 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX7O95931 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX7O95931 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX7O95931 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX7O95931 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX7O95931 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX7O95931 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX7O95931 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX7O95931 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX7O95931 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX7O95931 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX7O95931 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX7O95931 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX7O95931 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CBX7O95931 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CBX7O95931 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CBX7O95931 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CBX7O95931 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CBX7O95931 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CBX7O95931 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CBX7O95931 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CBX7O95931 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX7O95931 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX7O95931 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX7O95931 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX7O95931 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX7O95931 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX7O95931 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX7O95931 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX7O95931 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX7O95931 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX7O95931 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX7O95931 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX7O95931 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX7O95931 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX7O95931 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX7O95931 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX7O95931 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX7O95931 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms