Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POP4O95707 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POP4O95707 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POP4O95707 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POP4O95707 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POP4O95707 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POP4O95707 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POP4O95707 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POP4O95707 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POP4O95707 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POP4O95707 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POP4O95707 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POP4O95707 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POP4O95707 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POP4O95707 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POP4O95707 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POP4O95707 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POP4O95707 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POP4O95707 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POP4O95707 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
POP4O95707 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POP4O95707 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POP4O95707 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POP4O95707 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POP4O95707 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POP4O95707 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POP4O95707 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POP4O95707 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
POP4O95707 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POP4O95707 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POP4O95707 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
POP4O95707 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
POP4O95707 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POP4O95707 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POP4O95707 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POP4O95707 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POP4O95707 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POP4O95707 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POP4O95707 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POP4O95707 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POP4O95707 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POP4O95707 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POP4O95707 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POP4O95707 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POP4O95707 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POP4O95707 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POP4O95707 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POP4O95707 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POP4O95707 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POP4O95707 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POP4O95707 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POP4O95707 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POP4O95707 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POP4O95707 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POP4O95707 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POP4O95707 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POP4O95707 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POP4O95707 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POP4O95707 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POP4O95707 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POP4O95707 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POP4O95707 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POP4O95707 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POP4O95707 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POP4O95707 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POP4O95707 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POP4O95707 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POP4O95707 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POP4O95707 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POP4O95707 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POP4O95707 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POP4O95707 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POP4O95707 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POP4O95707 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POP4O95707 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POP4O95707 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POP4O95707 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POP4O95707 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POP4O95707 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POP4O95707 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
POP4O95707 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POP4O95707 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POP4O95707 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POP4O95707 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POP4O95707 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POP4O95707 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POP4O95707 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POP4O95707 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POP4O95707 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POP4O95707 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POP4O95707 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
POP4O95707 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
POP4O95707 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POP4O95707 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POP4O95707 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POP4O95707 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POP4O95707 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POP4O95707 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POP4O95707 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
POP4O95707 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms