Protein–RNA interactions for Protein: O60636

TSPAN2, Tetraspanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN2O60636 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN2O60636 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms