Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CXCL13O43927 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms