Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

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Length 872 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNQ3O43525 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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