Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSH5O43196 ALDH1L1-AS1-201ENST00000512384 437 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSH5O43196 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSH5O43196 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSH5O43196 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSH5O43196 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSH5O43196 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSH5O43196 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MSH5O43196 AC005393.1-201ENST00000617916 584 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MSH5O43196 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MSH5O43196 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSH5O43196 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSH5O43196 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSH5O43196 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSH5O43196 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSH5O43196 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSH5O43196 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSH5O43196 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSH5O43196 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSH5O43196 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSH5O43196 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSH5O43196 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSH5O43196 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSH5O43196 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSH5O43196 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSH5O43196 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSH5O43196 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSH5O43196 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSH5O43196 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSH5O43196 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSH5O43196 CLEC4C-201ENST00000354629 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSH5O43196 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSH5O43196 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MSH5O43196 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSH5O43196 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSH5O43196 AC002076.1-201ENST00000435257 527 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSH5O43196 AL356273.1-201ENST00000441261 1152 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MSH5O43196 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSH5O43196 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSH5O43196 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MSH5O43196 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSH5O43196 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSH5O43196 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSH5O43196 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSH5O43196 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSH5O43196 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MSH5O43196 IGFL2-AS1-203ENST00000598518 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSH5O43196 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSH5O43196 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSH5O43196 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSH5O43196 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSH5O43196 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSH5O43196 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSH5O43196 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSH5O43196 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSH5O43196 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSH5O43196 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSH5O43196 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSH5O43196 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSH5O43196 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSH5O43196 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSH5O43196 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSH5O43196 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSH5O43196 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSH5O43196 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSH5O43196 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSH5O43196 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSH5O43196 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSH5O43196 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSH5O43196 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSH5O43196 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSH5O43196 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSH5O43196 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSH5O43196 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSH5O43196 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSH5O43196 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSH5O43196 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSH5O43196 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSH5O43196 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSH5O43196 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSH5O43196 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSH5O43196 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MSH5O43196 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSH5O43196 AC091901.1-201ENST00000517722 736 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSH5O43196 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSH5O43196 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSH5O43196 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MSH5O43196 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSH5O43196 AL049840.6-202ENST00000603373 279 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MSH5O43196 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSH5O43196 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSH5O43196 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSH5O43196 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSH5O43196 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSH5O43196 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSH5O43196 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSH5O43196 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MSH5O43196 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MSH5O43196 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MSH5O43196 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms