Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBDO15205 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBDO15205 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBDO15205 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBDO15205 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBDO15205 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBDO15205 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBDO15205 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBDO15205 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBDO15205 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBDO15205 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBDO15205 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBDO15205 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBDO15205 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBDO15205 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBDO15205 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBDO15205 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBDO15205 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBDO15205 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBDO15205 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBDO15205 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBDO15205 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBDO15205 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBDO15205 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBDO15205 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBDO15205 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBDO15205 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBDO15205 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBDO15205 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBDO15205 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBDO15205 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBDO15205 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBDO15205 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBDO15205 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBDO15205 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBDO15205 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBDO15205 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBDO15205 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBDO15205 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBDO15205 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBDO15205 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBDO15205 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBDO15205 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBDO15205 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBDO15205 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBDO15205 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBDO15205 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBDO15205 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBDO15205 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBDO15205 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBDO15205 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBDO15205 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBDO15205 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBDO15205 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBDO15205 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UBDO15205 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBDO15205 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBDO15205 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBDO15205 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UBDO15205 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UBDO15205 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBDO15205 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UBDO15205 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBDO15205 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBDO15205 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBDO15205 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBDO15205 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBDO15205 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBDO15205 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBDO15205 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBDO15205 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
UBDO15205 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
UBDO15205 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
UBDO15205 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBDO15205 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBDO15205 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBDO15205 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBDO15205 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBDO15205 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBDO15205 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBDO15205 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBDO15205 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBDO15205 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBDO15205 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBDO15205 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBDO15205 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBDO15205 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UBDO15205 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBDO15205 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBDO15205 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBDO15205 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UBDO15205 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBDO15205 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBDO15205 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBDO15205 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBDO15205 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBDO15205 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBDO15205 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBDO15205 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBDO15205 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms