Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP290O15078 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP290O15078 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP290O15078 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP290O15078 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP290O15078 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP290O15078 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP290O15078 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP290O15078 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP290O15078 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP290O15078 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP290O15078 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP290O15078 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP290O15078 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP290O15078 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP290O15078 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP290O15078 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP290O15078 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP290O15078 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP290O15078 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP290O15078 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP290O15078 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP290O15078 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP290O15078 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP290O15078 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP290O15078 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP290O15078 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP290O15078 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP290O15078 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP290O15078 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP290O15078 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP290O15078 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP290O15078 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP290O15078 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP290O15078 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP290O15078 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP290O15078 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP290O15078 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP290O15078 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP290O15078 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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CEP290O15078 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP290O15078 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP290O15078 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP290O15078 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP290O15078 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP290O15078 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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CEP290O15078 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP290O15078 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP290O15078 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP290O15078 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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CEP290O15078 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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CEP290O15078 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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CEP290O15078 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP290O15078 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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CEP290O15078 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
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CEP290O15078 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP290O15078 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP290O15078 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP290O15078 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP290O15078 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP290O15078 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP290O15078 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP290O15078 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP290O15078 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP290O15078 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP290O15078 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP290O15078 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP290O15078 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP290O15078 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP290O15078 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP290O15078 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP290O15078 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP290O15078 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP290O15078 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP290O15078 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP290O15078 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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