Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3C2AO00443 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms