Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms