Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVV-2B6SEH9 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVV-2B6SEH9 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms