Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL33A6NCF5 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms