Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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