Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWF9

TRBV2, T-cell receptor beta variable 2 (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV2A0A0J9YWF9 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV2A0A0J9YWF9 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV2A0A0J9YWF9 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV2A0A0J9YWF9 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV2A0A0J9YWF9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV2A0A0J9YWF9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV2A0A0J9YWF9 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV2A0A0J9YWF9 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV2A0A0J9YWF9 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV2A0A0J9YWF9 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV2A0A0J9YWF9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV2A0A0J9YWF9 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV2A0A0J9YWF9 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV2A0A0J9YWF9 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV2A0A0J9YWF9 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV2A0A0J9YWF9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRBV2A0A0J9YWF9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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TRBV2A0A0J9YWF9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV2A0A0J9YWF9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV2A0A0J9YWF9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV2A0A0J9YWF9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV2A0A0J9YWF9 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV2A0A0J9YWF9 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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TRBV2A0A0J9YWF9 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV2A0A0J9YWF9 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV2A0A0J9YWF9 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV2A0A0J9YWF9 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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TRBV2A0A0J9YWF9 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV2A0A0J9YWF9 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV2A0A0J9YWF9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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TRBV2A0A0J9YWF9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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