Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms