Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHANK2Q9UPX8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms