Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SETD1BQ9UPS6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1BQ9UPS6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms