Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms