Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms